அவை அசல் மற்றும் பெப்டைட்களுக்கு இடையிலான இணைப்பு மூலம் இரண்டு அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட அமினோ அமிலங்களின் ஒன்றியத்தைக் குறிக்கின்றன. தயாரிப்புகளிலும் புரதங்களிலும், இந்த பிணைப்புகள் பெப்டைட் பிணைப்புகள் மற்றும் கார்பாக்சைல் குழுவின் எதிர்வினையின் விளைவாக, மற்றொரு அமினோ குழுவுடன், நீர் மூலக்கூறு நீக்குவதோடு தொடர்புடையவை.
பெப்டைட் பத்திர (-CO-NH-) பொதுவாக ஒரு ஒற்றை பத்திரமாகக் குறிப்பிடப்படுகின்றன. இல்லாமல் எனினும், என்று ஒரு இரட்டை பத்திரமாகக் தோராயமான பண்புகள் பல உள்ளன. நைட்ரஜன் ஆக்ஸிஜனைக் காட்டிலும் குறைவான எலக்ட்ரோநெக்டிவ் என்பதால், CO பிணைப்பில் 60% இரட்டை பிணைப்பு தன்மை உள்ளது, அதே நேரத்தில் சிஎன் பிணைப்பு 40% ஆகும். எனவே, பெப்டைட் பிணைப்பின் CO மற்றும் NC பிணைப்புகள் ஒற்றை பிணைப்புக்கும் இரட்டை பிணைப்புக்கும் இடையில் இடைநிலை பண்புகளைக் கொண்டுள்ளன. உண்மையில், CO மற்றும் CN பிணைப்புகளில் அளவிடப்படும் பரஸ்பர தூரங்கள் ஒற்றை இணைப்புகளுக்கும் இரட்டை பிணைப்புக்கும் இடையில் இடைத்தரகர்கள். இந்த அணு ஏற்பாடு அதிர்வு மூலம் உறுதிப்படுத்தப்படுகிறது, இதனால் பெப்டைட் பிணைப்பை உருவாக்குவதில் ஈடுபட்டுள்ள ஆறு அணுக்கள் ஒரே விமானத்தில் உள்ளன.
அதிர்வுகளின் மற்றொரு முக்கியமான விளைவு என்னவென்றால், இது பெப்டைட் பிணைப்பின் துருவமுனைப்பை அதிகரிக்கிறது மற்றும் இருமுனை தருணத்தை நிறுவுகிறது (மேலே உள்ள அட்டவணையில் சரியான உருவம்). இந்த காரணத்திற்காக, ஒவ்வொரு பெப்டைட் பிணைப்பும் இரண்டு ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகளில் பங்கேற்கலாம். அவற்றில் ஒன்றில், -NH- குழு ஒரு ஹைட்ரஜன் நன்கொடையாளராகவும் மற்றொன்று -CO- குழு ஹைட்ரஜன் ஏற்பியாகவும் செயல்படுகிறது. இந்த சொத்து புரதங்களின் முப்பரிமாண மடிப்புக்கு கணிசமாக பங்களிக்கிறது, பின்னர் பார்ப்போம்.
பகுதி இயல்பு இரட்டைப் பிணைப்பின் பெப்டைட் பிணைப்பில் சி மற்றும் N அணுக்கள் இணைகிறது இணைப்புக்கு இலவச சுழற்சி தடுக்கிறது. இரட்டை பிணைப்பின் இந்த விறைப்பு பெப்டைட்களின் இணக்க சாத்தியங்களை கட்டுப்படுத்துகிறது. இரண்டு சாத்தியமான உள்ளமைவுகள் உள்ளன:
- சிஸ் உள்ளமைவு: இரண்டு Ca களும் இரட்டை பிணைப்பின் ஒரே பக்கத்தில் உள்ளன.
- டிரான்ஸ் உள்ளமைவு: இரண்டு Ca களும் இரட்டை பிணைப்பின் வேறு பக்கத்தில் உள்ளன.
பொதுவாக, பெப்டைட் பிணைப்பு ஒற்றை பிணைப்பாக குறிப்பிடப்படுகிறது என்பதை கவனத்தில் கொள்ள வேண்டும். எந்தவொரு சந்தர்ப்பத்திலும், இது பல குணாதிசயங்களைக் கொண்டுள்ளது, இது இரட்டை பிணைப்புக்கு நெருக்கமாகிறது. அதனால்தான் வல்லுநர்கள் பொதுவாக ஒரு பெப்டைட் பிணைப்பு ஒரு ஒற்றை பிணைப்புக்கும் இரட்டை பிணைப்புக்கும் இடையில் பாதியிலேயே வைக்கும் பண்புகளைக் கொண்டிருப்பதாகக் குறிப்பிடுகின்றனர்.