மூலக்கூறு என்ற சொல் லத்தீன் வார்த்தையான "மோல்ஸ்" என்பதன் குறைவு, அதாவது நிறை, எனவே மூலக்கூறு என்றால் "சிறிய நிறை" என்று பொருள். ஒரு மூலக்கூறு என்பது இரண்டு அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட அணுக்களின் ஒன்றியம் அல்லது தொகுப்பாகும், அவை ஒரே மாதிரியாகவோ அல்லது வேறுபட்டதாகவோ இருக்கலாம், இந்த அணுக்கள் பிரிக்கப்பட்டால் அது பொருளின் பண்புகளை மாற்றிவிடும்.
ஒரு மூலக்கூறு என்பது ஒரு நிலையான மற்றும் மின்சார நடுநிலை அமைப்பாகும், இது இரசாயன பிணைப்புகளால் இணைக்கப்பட்ட இரண்டு அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட அணுக்களின் தொகுப்பால் ஆனது, அவை கோவலன்ட் பிணைப்புகள் என்று அழைக்கப்படுகின்றன. இந்த அணுக்கள் ஹைட்ரஜன் (எச் 2) மற்றும் ஆக்ஸிஜன் (ஓ 2) போன்றவையாக இருக்கலாம், அவை டையடோனிக் மூலக்கூறுகளாக இருக்கின்றன, அல்லது அவை வெவ்வேறு அணுக்களால் உருவாக்கப்படலாம் , இது இரண்டு ஹைட்ரஜன் அணுக்களால் ஆன நீர் (எச் 2 ஓ) போன்றது. மற்றும் ஆக்ஸிஜன் மற்றும் மீத்தேன் வாயு (சிஎச் 4) ஆகியவற்றின் மூலக்கூறில் நான்கு ஹைட்ரஜன் அணுக்கள் கார்பனுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளன.
மூலக்கூறு விஷயம் எனவே அது இராசயன பண்புகள் தக்கவைத்து முடியும் என்று பெறலாம் என்று சிறிய பகுதியை கருதப்படுகிறது. மூலக்கூறுகள் உருவாக முக்கிய காரணம் என்னவென்றால், குறைந்தபட்ச ஆற்றல் நிலையை அடையக்கூடிய அணுக்கள் உள்ளன, இதை அடைய அது அதே நிலையை முன்வைக்கும் பிற அணுக்களுடன் கோவலன்ட் பிணைப்புகள் மூலம் அவ்வாறு செய்கிறது, இந்த பிணைப்பை எளிதில் கரைக்க முடியாது, மற்றும் ஒரு மூலக்கூறு பிறக்கும் போது தான்.
ஒரு பொருளில், அவற்றை உருவாக்கும் மூலக்கூறுகள் நிலையானவை அல்ல, மாறாக, அவை நிலையான இயக்கத்தில் உள்ளன, அவை மூலக்கூறு அதிர்வு என்று அழைக்கப்படுகின்றன, மேலும் இது நெகிழ்வு அல்லது பதற்றமாக இருக்கலாம்.